CIENTÍFICOS
CONSTRUYERON DECENAS DE MILES DE ÁRBOLES EVOLUTIVOS DE ESPECIES PARA UNIRLOS EN
UNO SOLO, EL MÁS COMPLETO Crean "árbol de la vida" digital Este árbol
circular de las formas de vida de la Tierra se considera un primer borrador. |
Duke University - . Agencia Científicos acaban de lanzar un proyecto de
"árbol de la vida" que incluye 2,3 millones de especies nombradas y
existentes, convirtiéndolo en el más grande y completo. Es el primer intento de
combinar automáticamente los árboles evolutivos (filogenia) en un árbol integral
de la vida. La publicación, lanzada a través de una plataforma digital
(tree.opentreeoflife.org), es sólo el principio. El árbol de la vida será
actualizado basado en la retroalimentación y las contribuciones de nuevos datos
publicados, es decir, que crecerá constantemente incluyendo nuevas especies o
hallazgos. El primer borrador del "árbol de la vida" incluye a las
aproximadamente 2,3 millones de especies nombradas de animales, plantas, hongos
y microbios. En un esfuerzo de colaboración entre 11 instituciones, incluyendo
la Universidad de Michigan y la Universidad de Duke, el árbol representa las
relaciones entre los seres vivos a medida que cambiaron desde el comienzo de la
vida en la Tierra hace más de 3,5 millones de años. Decenas de miles de árboles
más pequeños se han publicado en los últimos años para selectas ramas del
árbol, algunas con más de 100.000 especies, pero esta es la primera vez que
esos resultados se han combinado en un solo árbol que abarca toda la vida. El
resultado final es un recurso digital que está disponible gratis en línea para
que cualquier persona utilice o modifique, muy similar a una “Wikipedia” para
los árboles evolutivos, informó un comunicado de la Universidad de Michigan. La comprensión de cómo las millones de especies
en la Tierra están relacionadas entre sí ayudará a los científicos a descubrir
nuevos fármacos, aumentar la productividad de los terrenos, y trazar los
orígenes y la propagación de enfermedades infecciosas como el VIH, el Ébola y
la gripe, explicó. “Este es el primer intento real de conectar los puntos y
poner todo junto”, dijo el investigador principal Karen Cranston, de la
Universidad de Duke. “Imagínatelo como la versión 1.0.” Un documento que resume
los hallazgos fue publicado en línea en la revista "Proceedings of the
National Academy of Sciences (PNAS)", el 18 de septiembre. El biólogo evolutivo de la Universidad de
Michigan Stephen Smith encabeza el grupo que abordó los detalles esenciales de
juntar todas las ramas, tallos y troncos de árbol de la vida en un solo
diagrama. Cody Hinchliff, anteriormente investigador postdoctoral en el
laboratorio de Smith, que ahora está en la Universidad de Idaho, hizo gran
parte del trabajo pesado en el proyecto y comparte créditos de primer autor con
Smith en la publicación de las revista PNAS. Gran árbol En lugar de construir el árbol de la vida a partir de
cero, los investigadores lo reconstruyeron mediante la compilación de miles de
fragmentos más pequeños que ya habían sido publicados en línea y su fusión dio
como resultado un gigantesco “superárbol” que abarca todas las especies
citadas. “Muchos de los participantes en el proyecto aportaron buscando miles
de árboles en la literatura, y después seleccionando 484 de ellos que se
utilizaron para generar el proyecto de árbol de la vida”, dijo Hinchliff. “Además
del proceso de combinar árboles existentes, gran parte de lo que se hizo en la
Universidad de Michigan fue el desarrollo de herramientas y técnicas y el
análisis del árbol en sí”, dijo Smith. “Para completar este proyecto, hemos
tenido que codificar nuestras propias soluciones. No había ya nada hecho que
podíamos usar”, agregó. El objetivo era crear herramientas de software y
algoritmos que equilibraran rendimiento y
eficiencia al combinar una gran cantidad de árboles, señaló por su parte
Hinchliff. “Nuestro software, que se llama ‘treemachine,’ tomó unos días para
generar el proyecto de árbol actual de la vida en una estación de trabajo de
escritorio moderadamente equipado en la oficina de Stephen”, dijo, añadiendo
que otros programas hubieran demorado semanas para hacer el mismo trabajo. La
investigación fue financiada por una beca de tres años de 5,7 millones de
dólares de la Fundación Nacional de la Ciencia de Estados Unidos. La versión
del árbol, junto con los datos subyacentes y de la fuente de código, está
disponible para navegar y descargar. Desafíos
Los científicos superaron varios desafíos para construir el árbol. Uno de
los mayores retos fue definir los nombres exactos de las especies que a veces
tienen nombres alternativos, faltas de ortografía comunes y abreviaturas. El
murciélago rojo del este, por ejemplo, a menudo aparece bajo dos nombres
científicos, Lasiurus borealis y boreal Nycteris. Los osos hormigueros
espinosos compartieron por mucho tiempo su nombre científico con un grupo de
murénidos, una familia de peces anguiliformes conocidos como morenas. "Este
proyecto del árbol de la vida representa sólo un primer paso", dijeron los
investigadores. Por un lado, sólo una pequeña fracción de los árboles está
digitalmente disponible. Una investigación realizada a más de 7.500 estudios
filogenéticos publicados entre 2000 y 2012 en más de 100 revistas encontró que
sólo uno de cada seis estudios había depositado sus datos en un formato
digital, descargable, que los investigadores podrían utilizar. La gran mayoría
de los árboles evolutivos se publican en formato PDF y otros archivos de imagen
son imposibles de ingresar en una base de datos o fusionarse con otros árboles.
"Hay una muy gran diferencia entre la suma de lo que los científicos saben
sobre cómo se relacionan los seres vivos, y lo que está realmente disponible
digitalmente", señaló Cranston, según un comunicado de la Universidad de
Duke. Como resultado, las relaciones que se muestran en algunas partes del
árbol, como las ramas que representan a las familias de guisantes y de
girasoles, no siempre están de acuerdo con la opinión de los expertos. Otras
partes del árbol, particularmente de insectos y microbios, están siendo
difíciles de estructurar porque incluso
el archivo en línea más popular de secuencias genéticas primas –de las que se
construyeron muchos árboles evolutivos–contiene datos de ADN de menos del 5 por
ciento de las decenas de millones de especies que se estima existen en la
Tierra. "Tan importante como mostrar lo que sabemos acerca de las
relaciones, este primer árbol de la vida también es importante en la revelación
de lo que no sabemos", dijo el coautor Douglas Soltis de la Universidad de
Florida. "Hace 25 años se decía que este objetivo de lograr un gran árbol
era imposible", dijo Soltis. "Este árbol de la vida es un punto de
partida importante que otros investigadores ahora pueden perfeccionar",
agregó. Tomado de los tiempos de Bolivia
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